وصت مراكز السيطرة على الأمراض و الوقاية منها (CDC) : "كما ذكر مرارا وتكرارا، يجب تنظيف العناصر باستخدام الماء مع المنظفات أو منظفات إنزيمية قبل المعالجة. التنظيف يقلل من البقايا العضوية ويزيل المواد الأجنبية. التي تتداخل مع عملية التعقيم من خلال العمل كحاجز أمام وكيل التعقيم".
لتنظيف وتعقيم المواقع يتبع فريق العمل توصيات منظمة الصحة العالمية حاليًا على استخدام كحول بنسبة 70% أو بإستخدام الحرارة كما ذكرايضا بالموقع الرسمي لمراكز السيطرة على الأمراض و الوقاية منها (CDC). ومما يميز التنظيف والتعقيم بالبخار المشبع عالي الحرارة تحت الضغط هو قدرتة على اذابة وازالة الرواسب العنيدة بالإضافة الى أنه مبيد للجراثيم ، ومبيد للأبواغ.
